Podpis ekspresji genowej jako predyktor przeżycia w raku piersi ad 5

Wszystkie obliczenia przeprowadzono przy użyciu pakietu statystycznego S Plus 2000 lub S Plus 6. Wyniki
Kategoryzacja sygnatur ekspresji genów
Ryc. 1. Ryc. 1. Wzór ekspresji genów używanych do określenia rokowania i charakterystyki klinicznej 295 pacjentów z rakiem piersi. Panel A pokazuje wzór ekspresji genów markerowych 70 (określanych również jako geny klasyfikatora prognostycznego9) w serii 295 kolejnych pacjentów z rakiem sutka. Każdy rząd reprezentuje profil prognostyczny 70 genów markerowych dla jednego guza, a każda kolumna reprezentuje względny poziom ekspresji jednego genu. Guzy są ponumerowane od do 295 na osi y, a geny są ponumerowane od do 70 na osi x. Geny w kierunku poziomym są uszeregowane w tej samej kolejności, co w naszym poprzednim badaniu.9 Czerwony wskazuje na wysoki poziom ekspresji informacyjnego RNA (mRNA) w guzie, w porównaniu z poziomem referencyjnym mRNA, a zielony wskazuje na niski poziom poziom ekspresji. Linia przerywana jest uprzednio wyznaczoną wartością progową między podpisem dobrej prognozy a sygnaturą złego rokowania. Guzy uszeregowano zgodnie z ich korelacją z wcześniej ustalonym średnim profilem w nowotworach od pacjentów z dobrym rokowaniem. Panel B pokazuje czas od lat do odległych przerzutów jako pierwsze zdarzenie dla tych, u których to wystąpiło, i całkowity czas trwania obserwacji dla wszystkich innych pacjentów. Panel C pokazuje stan węzłów chłonnych (niebieskie znaczniki wskazują na chorobę z węzłem chłonnym i białą chorobę węzła chłonnego), liczbę pacjentów z odległymi przerzutami w pierwszym zdarzeniu (niebieskie znaczniki) i liczbę pacjentów który zmarł (niebieskie znaki).
Tabela 1. Tabela 1. Związek między charakterystykami klinicznymi a sygnaturą rokowania. Całkowity RNA z każdego nowotworu został wyizolowany i wykorzystany do wytworzenia cRNA, który został wyznakowany i hybrydyzowany z mikromacierzami zawierającymi około 25 000 ludzkich genów. Fluorescencyjne natężenia zeskanowanych obrazów zostały określone ilościowo i znormalizowane. Obliczyliśmy stosunek tych wartości do intensywności puli referencyjnej złożonej z równych ilości cRNA ze wszystkich guzów. Stosunki ekspresji genów wcześniej określonych genów markerowych dla wszystkich 295 guzów w tym badaniu pokazano na Figurze 1A. 115 guzów o wartościach powyżej wcześniej ustalonej wartości progowej9 przypisano do kategorii dobrej prognozy, a 180 poniżej progu przypisano do kategorii złego rokowania. Figura 1B pokazuje czas do odległych przerzutów jako pierwsze zdarzenie, jak również całkowity czas trwania obserwacji dla wszystkich pacjentów, którzy nie mieli odległych przerzutów jako pierwsze zdarzenie. Figura 1C przedstawia status węzła chłonnego, status odległych przerzutów i całkowity czas przeżycia dla wszystkich 295 pacjentów. Porównując rys. 1A, 1B i 1C można zauważyć, że istnieje silna korelacja między dobrym rokowaniem a brakiem (wczesnych) odległych przerzutów lub śmierci. Pacjenci z chorobą z ujemnym węzłem chłonnym oraz z chorobą z węzłem chłonnym byli równomiernie rozłożeni w dwóch grupach, co wskazuje, że profil rokowania jest niezależny od statusu węzłów chłonnych. Tabela 1, która podsumowuje związek między profilem rokowania a zmiennymi klinicznymi, pokazuje, że profil rokowania był znacząco związany ze stopniem histologicznym guza (P <0,001), stanem receptora estrogenu (P <0,001) i wiekiem ( P <0,001), ale nie w przypadku średnicy guza, stopnia inwazji naczyniowej, liczby dodatnich węzłów chłonnych lub leczenia.
Wartość prognostyczna podpisu ekspresji genów
Tabela 2
[podobne: honorowy dawca krwii, operacja siatkówki oka cena, zostan dawca szpiku ]
[więcej w: ośrodek leczenia uzależnień kraków, stomatolog bemowo, orsalit ulotka ]